本課程以「臺灣區域海洋學 (2nd edition)」為基本教材，以臺灣周圍海域歷年研究成果為基礎，範圍涵蓋東海、南海、臺灣海峽及黑潮流域，分別邀請各領域專家介紹海洋地質與地球物理、海洋物理環境、海水運動概況、海洋化學、海洋生態及海洋生物多樣性等，並且基於對臺灣區域海洋的了解，放眼全球海洋及海洋的未來。
本書鋪陳的海洋知識是進入西北太平洋海洋研究的跳板，也是未來評判氣候變遷全球暖化程度的比較基準；除了順帶記錄我國海洋研究、研究船運作與海上探測半個世紀的發展歷程與傲人成績，也提出新興系統海洋研究之前瞻構想，引領全球海洋研究方向。